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透景生命 / 个性化用药基因检测相关资料 / DNA甲基化——拨动肿瘤开关的隐形之手

DNA甲基化——拨动肿瘤开关的隐形之手

Tellgen
2017-11-27 09:52:14  阅读量:977
导读:DNA甲基化是表观遗传调控的一种,在DNA甲基化转移酶(Dnmt)作用下将甲基选择性的添加在C或G碱基上。基因启动子甲基化以后基因表达就会减弱甚至关闭,简单来说就是基因的开关。DNA甲基化与恶性肿瘤的发生密切相关,几乎所有肿瘤中都会伴随DNA甲基化的改变,多数发生在肿瘤早期,且常常高甲基化与低甲基化并存:抑癌基因启动子甲基化后其表达受抑制就丧失了抑癌功能,从而促进癌症的发生;低甲基化通常是整个基因组低甲基化或原癌基因启动子低甲基化,前者会导致染色体结构稳定性降低,突变率增加,后者则会激活原癌基因,诱导细胞癌变。总之,DNA甲基化模式异常常导致抑癌基因失活、原癌基因激活、染色体失稳、基因突变及miRNA表达失调,任何一方面异常都有可能导致肿瘤的发生。


抑癌基因失活
抑癌基因启动子区高甲基化可抑制基因表达,导致抑癌基因功能丧失。抑癌基因失活是多种肿瘤发生过程的常见现象,是非常具有潜力的肿瘤早期诊断标志物。
【案例】肺癌:SHOX2基因高甲基化与肺癌密切相关,有助于鉴别肺部良性病变与恶性肿瘤。SHOX2甲基化检测对肺癌诊断的特异性高达95%,灵敏度为68%。且对肺鳞癌和小细胞肺癌的诊断灵敏度更高,分别为82%和97%,目前已获CE批准应用于临床。此外,RASSF1A作为一种新型的肿瘤抑制基因,其甲基化与肺癌发生密切相关。研究发现71%的NSCLC细胞株和44%的原发肺癌中存在RASSFlA的甲基化,而在正常肺组织中却没有出现该基因的甲基化,且该基因的甲基化与患者的年龄、性别以及肿瘤的组织类型、分化程度和病理分型无明显相关性。两者相结合将有效提高对肺癌诊断的特异性。
结直肠癌:研究发现SEPT9基因在结直肠癌发生发展过程中常被甲基化,高甲基化率高达90%以上。多个临床中心实验研究表明SEPT9基因甲基化可作为结直肠癌早期诊断优势生物标志物之一。《2015年美国癌症筛查指南》明确提出将DNA甲基化检测列入结直肠癌筛查的可选指标。


癌基因激活
癌基因重新激活是癌变过程中常见变化之一,癌基因激活是促进细胞癌变的重要因素。而原癌基因启动子的去甲基化是其激活的重要原因。
【案例】直肠癌:早期直肠癌中LINE-1启动子区甲基化水平显著降低,是增加直肠癌病死率的独立危险因子。
乳腺癌:乳腺癌组织中白介素-10(IL-10)启动子甲基化水平远低于正常组织,其低甲基化与KI-67高表达显著相关。

染色体失稳
恶性肿瘤细胞中常见整体基因组低甲基化。低甲基化可导致基因突变率提高,增加杂合性缺失、降低染色体凝聚度、改变原有构象,使其更易受外界因素的影响。
【案例】肝癌全基因组呈低甲基化:肝脏全基因组低甲基化主要发生在DNA重复序列,影响基因组甲基化区重复序列的稳定性,使得长核苷酸元件LINE-1、逆转录病毒脑池内A颗粒及Alu序列因去甲基化而重新活跃。

基因突变
DNA甲基化引起基因突变主要是由于DMT催化反应形成。DMT可以加快胞嘧啶的脱氨成为尿嘧啶,并封闭尿嘧啶的修复,完成胞嘧啶向胸腺嘧啶的转变,产生T:G的错配,在DNA复制过程中,改变遗传信息。
【案例】抑癌基因p53的突变与很多癌症相关,如肝癌、乳腺癌、膀胱癌、胃癌、结肠癌、前列腺癌、软组织肉瘤、卵巢癌、脑瘤、淋巴细胞肿瘤、食道癌、肺癌、成骨 肉瘤等。50%的实体肿瘤患者出现p53基因突变,突变中24%是CpG 甲基化后脱氨引起的C→T 突变。

miRNA表达失活
miRNA在很多生物过程和细胞途径中扮演着非常重要的角色,通过抑制目标基因的表达实现对细胞生物学功能的调控。恶性肿瘤中常常出现miRNA表达缺失,这主要是由于miRNA启动子区高甲基化所致。
【案例】头颈部鳞状细胞癌:部分患者miR-137启动子区高甲基化使其表达受抑制,这些患者总生存率显著降低。

大量研究表明,DNA甲基化异常改变与肿瘤发生发展密切相关,这就为DNA甲基化检测作为癌症的诊断和治疗提供了新的思路。由于在肿瘤发生早期就有DNA甲基化发生,而且部分甲基化水平与肿瘤发展成正相关,因此,DNA甲基化检测在肿瘤的早期筛查、临床分期和预后评估方面极具潜力。加快推动DNA甲基化在临床中的应用,可为广大肿瘤患者带来福音。

 
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